blank'/> muhilneel: Science
Showing posts with label Science. Show all posts
Showing posts with label Science. Show all posts

Saturday, August 3, 2013

பிரம்ம கமலம்




நாம் பலவகையான தாவரங்களை அறிவோம். வித்து (Seeds) தாவரங்கள், கிழங்கிலிருந்து (tubers,bulbs ) உற்பத்தியாகும் தாவரங்கள்,வெட்டி வைக்கும் தண்டுகளில் இருந்து புதிய கிளைகளும் இலையும் தளைக்கும் தாவரங்கள் (Striking / Cloning) என்று பலவகைத் தாவரங்களும் உண்டு. ஓர் இலை மட்டும் கூட ஓர் பெரிய செடியை உருவாக்கும் ஆற்றல் பெற்றிருக்கும். அப்படிப்பட்ட ஓர் தாவரம் தான் நிஷாகந்தி என்றழைக்கப்படும் பிரம்ம கமலம்.

இத்தாவரத்தின் அறிவியல் இருசொற் பெயர்  ( Binomial Nomenclature)  Epiphyllum oxypetalum  என்பதாகும்.

இம்மலர்  தமிழ் மற்றும் தெலுங்கு மொழியில், பிரம்ம கமலம் என்றும், மலையாளத்தில் நிஷாகந்தி  என்றும், ஆங்கிலத்தில்   Queen of the Night, Night-blooming Cereus, Large-flowering Cactus, Sweet-scented Cactus, Vanilla Cactus, Lunar Flower, Large Blooming Cereus, Large flowered torch thistle, Large-flowered Night Cactus என்று பல மொழிகளில் அழைக்கப்படுகிறது.

அறிவியல் வகைப்பாடு

Kingdom : Plantae
(unranked) : Angiosperms
(unranked) : Eudicots
(unranked) : Core Eudicots
Order : Caryophyllales
Family : Cactaceae
Genus : Epiphyllum
Species : E.oxypetalum

நீண்டு சற்று அகலமானதாக இருக்கும் இலைகளைக் கொண்டது இத்தாவரம். இலையினைப் பாதியளவு மண்ணுள் புதையுண்டு இருக்குமாறு  நட்டு வைத்துவிட்டால், இலையே புதிதாக வேர்விட்டு மண்ணில் பதிந்து கொள்ளும். அதன் பின், இலையே அத்தாவரத்தின் தண்டு போல் செயல்படும். இலையின் பக்கவாட்டுகளில், சிறுசிறு கணுக்கள் தோன்றி, அவற்றிலிருந்து புது இலைகள் உருவாகும். அதே கணுக்களில் தான் மொட்டுக்கள் உருவாகி கண்கவர் மலர்களாய் மலர்ந்து  மணம் வீசும்.

 
இம்மலர்களுக்கு  உரிய தனிச் சிறப்பு என்னவெனில், இவை இரவில் தான் மலரும்.இம்மலர்களின் வாசனை அபாரமானதாக இருக்கும். இத்தகைய அபார வாசனைக்கு காரணியான வேதிப் பொருள்  Benzyl Salicylate என்பதாகும். 


மலர்ந்து சிலமணி நேரங்களே இம்மலர்கள் மணம் பரப்புகின்றன. அதன்பின் வாடிப் போய்விடுகின்றன.இம்மலர்கள் வாடாமல்லி, மஞ்சள், சிகப்பு வெள்ளை,ஆரஞ்சு என்று பல்வேறு நிறங்களிலும் இருக்கின்றன.அனைத்து மலர்களும் இரவிலேயே மலர்கின்றன.


 





ஒரு செடியில் அதிகபட்சமாக நான்கு முதல் ஐந்து மலர்கள் வரை இருக்கும். சில சமயங்களில் அதிசயத்தக்க வகையில் , பத்து முதல் பதினைந்து மலர்கள் வரையிலும் இருக்கலாம்.அனைத்தும் ஒரே நேரத்தில் மலர்ந்து , நம்மை வாசனையால் கிறங்கடிக்கலாம். 

படங்களுக்கு நன்றி.
1. jaghamani.blogspot.com
2. indiastudychannel.com
3. flikr.com
4.digplanet.com
5.parayilat.blogspot.com

Monday, July 29, 2013

செடிகளிடம் பேசுவது/ பாடுவது அவற்றின் வளர்ச்சிக்கு உறுதுணை புரியுமா ?





 விதையிலிருந்து   புத்துயிராய்  மண்ணில் ஜனிக்கும் சின்னஞ்சிறிய நாற்றுகள்   செழிப்பாக வளர்வதற்கு சூரியஒளி, நீர், வளமான மண் இவை மட்டும் போதாது. நமது  அன்பு , அக்கறை நிறைந்த பேச்சும், மென்மையான இசையும் அவற்றின் வளர்ச்சிக்கு துணையாய் இருக்கும் என்கின்றனர்  பயிரியலாளர்கள்.

இதைப் பற்றி ஆராய்ச்சி மேற்கொண்ட அறிவியலாளர்கள், உண்மையிலேயே  அன்பாலும்  இசையாலும்  அதிகப்படியான மகசூல் கிட்டுகிறதா என்பதனை கண்டறிவதற்காக, அறுபது பட்டாணி செடிகளை எடுத்துக் கொண்டனர். அவற்றை மூன்று பிரிவுகளாக பிரித்து தனித்தனியே  மூன்று பசுமைக் குடில்களில் ( Green House ) வளர்த்தனர்.இரண்டு வகையான குரல்களைப் பதிவு செய்தனர். ஒன்று, மிகவும் அன்பும் கருணையும் நிறைந்த கனிவான குரல். மற்றொன்று ஏச்சும், ஆத்திரமும்  நிறைந்த குரல்.ஒரு பசுமைக் குடிலில் அன்பான குரலையும், மற்றொன்றில் ஆத்திரமான குரலையும் ஒலிக்கச் செய்தனர். மூன்றாம் குடிலில், எவ்விதமான ஒலியும் இல்லாது அமைதியாக வைக்கப்பட்டிருந்தது. அறுபது நாட்கள் இச்சோதனை முயற்சி மேற்கொள்ளப் பட்டது.

அறுபது  நாட்களுக்குப் பின், தாவரங்களின் வளர்ச்சி, அவற்றின் மகசூல் கணக்கிடப் பட்டன. எந்த பசுமைக் குடிலில் இருக்கும் தாவரங்கள் அதிக மகசூலை வழங்கியுள்ளன என்று கணக்கிட்டபோது,  எந்த இரு குடில்களில் குரல்கள்  ஒலித்துக் கொண்டிருந்தனவோ, அவை நல்ல மகசூலைக் கொடுத்திருந்தன. கனிவான குரல் கேட்டு வளர்ந்த தாவரங்கட்கும், ஆத்திரமான குரல் கேட்டு வளர்ந்த தாவரங்கட்கும் எந்தவொரு வித்தியாசமும் இல்லை. நல்ல மகசூலையே கொடுத்திருந்தன. ஆனால், அமைதியாக, ஒலியேதும் இல்லாது வளர்க்கப்பட்ட தாவரங்களின் மகசூல்  மிகவும் குறைவாக, அளவில் சிறிதான பட்டாணிகளையே கொடுத்திருந்தன.


எனவே, நமது பேச்சு செடிகளின் நல் வளர்ச்சிக்கு உறுதுணையாய் இருக்கின்றன. இனிமேல், செடிகளுக்கு நீரூற்றும் போது, சில நொடிகள் அவற்றுடன் பேசலாமே !!!


Source:  http://dsc.discovery.com/tv-shows/mythbusters/mythbusters-database/talking-to-plants.htm

 

Monday, July 22, 2013

சில மலர்கள் இரவில் மலர்வது ஏன் ?

செண்பகம்
மனோரஞ்சிதம்
சம்பங்கி

          சில மலர்களில் மகரந்தச் சேர்க்கை பூச்சிகளால் ஏற்படுகின்றது.அத்தகைய மலர்கள் இரவில் மட்டுமே மலர்கின்றன. அம்மலர்களின் வாசனை அபாரமாக இருக்கும்.மேலும், இரவில் மலரும் மலர்கள் வெண்மை நிறத்திலேயே இருக்கின்றன.இது அவற்றின் மரபணு தனிப்பண்பு ஆகும்.பகலில் மலரும் மலர்கள் பல்வேறு வண்ணங்களில் இருக்கின்றன.அதனால், வண்டுகள்,தேனீக்கள் போன்றவை அவைகளால் எளிதில் கவரப்படுகின்றன.வெண்ணிற மலர்கட்கு பகலில் வண்டுகள்,வண்ணத்துப் பூச்சிகளைக் கவரும் தன்மை குறைவு. எனவே, அவை இரவில் மலரும் தழுவலைப் (adaption) பெற்றுள்ளன. வெண்மை நிற மலர்கள் இருளில் நன்கு தெரிவதால், அவை பூச்சிகள்,வௌவால்கள் ஆகியவற்றை எளிதில் கவர்கின்றன.மேலும், இவற்றின் அபார வாசனை பூச்சிகளை தன்வசம் இழுக்கின்றன.மகரந்தச் சேர்க்கை நிகழ்கிறது.
 
                இரவில் மலரும் மலர்கள் சில: மல்லிகை, செம்பகம்,சம்பங்கி, மனோரஞ்சிதம்,வெண்தாமரை,நிஷாகந்தி.



மல்லிகை
வெண்தாமரை
நிஷாகந்தி

Friday, March 22, 2013

Rafflesia arnoldii



Rafflesia Arnoldii  bud

The Flower in full bloom


The flower with the world's largest bloom is the Rafflesia arnoldii. This rare flower is found in the rainforests of Indonesia. It can grow to be 3 feet across and weigh up to 15 pounds! It is a parasitic plant, with no visible leaves, roots, or stem. It attaches itself to a host plant to obtain water and nutrients. When in bloom, the Rafflesia emits a repulsive odor, similar to that of rotting meat. This odor attracts insects that pollinate the plant.  



The genus Rafflesia comprises 28 species of parasitic flowering plants, which are natives to the Southeast Asian rainforest. The most interesting fact about the genus is that one of its species - Rafflesia arnoldii, produces the world's largest single flower. The term rafflesia is popularly used to denote the flower of Rafflesia arnoldii.


Classification of  Rafflesia arnoldii

Scientific classification
Kingdom: Plantae
Division: Angiosperms
Class: Eudicots
(unranked): Rosids
Order: Malpighiales
Family: Rafflesiaceae
Genus: Rafflesia
Species: R. arnoldii
Source:

Titan Arum - The Corpse Flower





 Amorphophallus titanium

Amorphophallus titanum. Copyright © RBGKew
Fruit and Seedling of

Amorphophallus titanum

Titan arum in flower in Kew's Princess of Wales Conservatory 





















The titan arum is a giant among plants, with a massive flowering structure that rises some three metres above the ground. Its flowering is rare and unpredictable.

When the flowers are ready for pollination, the spadix heats up and emits a nauseating smell. This stench is so bad that the Indonesians call the plant ‘the corpse flower’.The inflorescence rises from a tuber, a swollen underground stem modified to store food for the plant. This tuber, more or less spherical in shape and weighing 70 kg or more, is the largest such structure known in the plant kingdom.




Species information
  • Common name(s): titan arum
  • Conservation status: Classified as Vulnerable (V) on the 1997 IUCN Red List of Threatened Plants.
  • Habitat: The titan arum dwells in the rainforests of western Sumatra, on steep hillsides that are 120 to 365 metres above sea level.
  • Known hazards: Emits a nauseating smell on flowering.

Taxonomy

  • Class: Equisetopsida
  • Subclass: Magnoliidae
  • Superorder: Lilianae
  • Order: Alismatales
  • Family: Araceae
  • Genus: Amorphophallus
  http://images.kew.org/r1/amorphophallus_titanum/print/655188.html

Tuesday, February 5, 2013

Carnivorous Plants - Brocchinia


http://www.araflora.com/image/data/Brocchinia-tatei_Flower_-1.jpg














                       

P.Tamizh Muhil Neelamegam

                   Brocchinia is a genus of bromeliads with about 20 known species. Among them, Brocchinia hechtioides and Brocchinia reducta are carnivores, since they entrap the insects. They live in swampy savannas on the top of the Venezulan tepuys.Their erect, yellow leaves have a cylindrical shape with a waxy slippery powder in the inner surface. The liquid emits a nectarious smell, and the leaves  contain trichomes which helps in absorbing the digested amino acids.The liquid is highly acidic. A sweet odor emanating from the tank may be the means of attracting insects.  

               Brocchinia reducta forms a water-storing cup with its tightly-overlapping leaves. The leaves surrounding the cup of Brocchinia reducta are coated with loose, waxy scales. These scales are highly reflective of ultraviolet light. Since many insects are attracted to ultraviolet (since it is reflected also by many flowers), this is an efficient lure. Mostly, ants and small insects are captured by this plant.

                  The scales, being loose, provide a poor foothold for insects landing on them. The unfortunate creatures slip into the water-filled cup, and eventually drown. It has been argued that Brocchinia reducta is not actually carnivorous in the sense of other such plants, because it does not produce pepsin or any other digestive proteases. However, bacteria and fungi digest the trapped insects, and the leaves are capable of absorbing the resulting nutrients.

                       The genus name Brocchinia honors the Italian botanist Giovanni Battista Brocchi (1772-1826). As far as I know, there are no "common names" for Brocchinia.


Note:
tepuy , is a table-top mountain or mesa found in the Guiana Highlands of South America, especially in Venezuela.


 References:

Interrelationship Between Insects and Plants By Pierre Jolivet, CRC Press, 1998

 http://florawww.eeb.uconn.edu/199600030.html

http://www.carnivorousplants.org/cp/Genera/images/Brocchinia.jpg

 http://www.araflora.com/image/data/Brocchinia-tatei_Flower_-1.jpg

http://davesgarden.com/guides/pf/go/73030/


To be continued....

Monday, January 21, 2013

Carnivorous Plants – Sundew


           Droseras, Commonly called as Sundews.They have gummy tentacles which attracts the insects by their bright colour and smell. Sundew is named because of the dew drops at the end of their tentacles which glitter when exposed to sunlight. They primarily grow on acidic bogs and moist sandy areas.

How does it captures its prey?
Once an insect lands on the leaf, the tentacles begin to wrap around the prey and the Sundew produces more digestive fluid. More tentacles wrap around the bug, and the digestive process begins. Within hours the Sundew has ingested its catch, leaving only the skeletal remains. Sundews have one of the more powerful digestive systems in the carnivorous plant world.

This video shows a Drosera plant trapping a midge with its mobile tenticles and rolling its leaf.

The researchers have found that the secret of the quick tentacles involves the releasing of pent-up hydraulic pressure in a sudden burst, and it happens fast.The sundew takes about 75 milliseconds to capture its prey with snap tentacles. These snap tentacles are  one-shot weapons.Once they capture a prey, these tentacles  break off.The sundew grows fast, developing new leaves every three to four days, so losing a snap tentacle does not affect the plant.

Medicinal uses of the sundew:
These sundews provide an effective remedy for respiratory ailments and chest problems including coughs, asthma,woophing cough, arteriosclerosis and bronchitis.The plant contains an antibiotic substance that, in pure form, is effective against Streptococcus, Staphylococcus, and Pneumococcus. In European folk medicine, the fresh juice is used for warts and corns, and is taken internally as an aphrodisiac.

References:
http://medicinalherbinfo.org/herbs/Sundew.html
http://www.livescience.com/23488-carnivorous-plants-sundew-tentacles-prey.html
http://www.gublers.com/Pages/Carnivorous%20Tabs/sundew.html

To be Continued…

Thursday, January 17, 2013

Carnivorous Plants


 
We all know that plants prepare their food by the process called Photosynthesis. But there are certain plants which depend on living organisms for their livelihood.Such plants are called Carnivorous Plants.


Carnivorous Plants are the plants which capture, kill and digest the insects and other small organisms.These carnivorous plants live in a soil that is deficient in Nutrients.So,they supplement their diet with nutrients obtained by digesting the  insects. These plants have some specialized leaves or flowers or tentacles to capture the prey and digest them.



A plant is said to be carnivore, if they possess the following characteristics:

  • The plant must have certain adaption to capture the prey. For example, a trap.
  • The plant should be able to digest the prey. It may produce certain digestive enzymes or it may rely on certain bacteria or other organisms for digestion.
  • The plant must be able to absorb the nutrients and it should be benefited by them. 
The Plants must possess certain adaptations to capture the prey.The adaptations include trap type and certain modifications in the trap that improve the efficiency of the plant in prey capture.The trapping mechanism always involves certain leaf modifications, in which the leaves acts as a trap.

The different trap types include

  • Pitfall traps
  • Sticky traps
  • Lobster pot traps
  • Suction traps
  • Snap traps
Certain examples for the modifications that improve the efficiency may include

  • The plant may produce an attractive smell
  • The trap will be more attractive and colorful
  • The surface of the trap may be waxy or slippery
  • The insects may get stuck to the hairs present 
  • The trap fluids may be sticky
  • The plant may produce nectar which tempts the prey

Tuesday, December 4, 2012

Important fields in bioinformatics / Branches of Bioinformatics

These are some of the important fields in bioinformatics

1. Structural Bioinformatics:


Predicting the 3D structure of a protein from its protein sequence. Homology modelling is the best method for predicting the protein structures by using already structured or crystallized protein as a template.

2. Drug Designing:


Drug design is the approach of finding drugs by design, based on their biological targets. Typically a drug target is a key molecule involved in a particular metabolic or signalling pathway that is specific to a disease condition or pathology, or to the infectivity or survival of a microbial pathogen.
Computer-assisted drug design uses computational chemistry to discover, enhance, or study drugs and related biologically active molecules.

3. Phylogenetics:


Predicting the genetic or evolutionary relation of set of organisms. Mitochondrial SNPs and Microsatellites ( DNA repeats) are mostly used in Phylogenetics. MEGA,PAUP are PAUP* are some of the important softwares. Maximum Parsimony and Maximum Likelyhood are mostly used methods.

4. Computational biology:


Computational biology is an interdisciplinary field that applies the techniques of computer science, applied mathematics, and statistics to address problems inspired by biology.

5. Population Genetics:


Population Genetics is a study of genotype frequency distribution and the change in the genotype frequencies under the influence of Natural selection, genetics drift, mutation and gene flow. Coalescent theory is one of the most used theory to predict the most recent ancester. Arlequin is one of the best and most used software in population gentics.

6. Genotype Analysis:


Genotype = Genetic variation, SNP,Mutation ....

1. Studying Genotype and phenotype association.
2. Studying Genotype frequencies. There is no specific software for genotype analysis. But its called the "Generation Next Market using Bioinformatics....". Genotyping is mostly done using Illumina and Affy microarry chips.


7. Splicing Site prediction:


Splicing prediction is a very important application of Bioinformatics which is very important in Gene expression studies. Visit also Alternative Splicing site Predictior.

8. MiRNA prediction:


MiRNA = MicroRNA. MiRNA emerged as a new Gene regulatory element and gained more space in research. 20 -23 base pair RNA which regulates a gene or genes. So many methods and softwares have been developed to predicting this tiny RNAs. But still they are not precise in predicting. It means that we need some more information from experimental labs to predict.

MiRNA binds to the gene and regulates the gene. Most of the time it down regulate the gene expression. Predicting the MiRNA target is also a very important problem in Bioinformatics.

Database..
miRNA Registry from Sanger Institute.

MiRNA target prediction software


There are so many softwares for miRNA and Target prediction....


9. RNA Structure prediction:


The functional form of single stranded RNA molecules frequently requires a specific tertiary structure. The scaffold for this structure is provided by secondary structural elements which are hydrogen bonds within the molecule. This leads to several recognizable "domains" of secondary structure like hairpin loops, bulges and internal loops. There has been a significant amount of bioinformatics research directed at the RNA structure prediction problem.

10. Gene Prediction:


Predicting the Gene by the predefined conditions. Comparative genomics is the best method for predicting the gene.

Some of the softwares..

GeneMark, Genscan


11. Transcription factor binding site prediction:


Predicting the transcription factor. Most common method is to use "Comparative genomics". And finding clusters of motifs in the noncoding part of gene.

12. Genome Annotation:


Predicitng the genes, coding and noncoding sequences are called genome annotation.
Most of the people follow comparative genomics to annotate the newly sequenced genomes.

GOLD is the database for ongoing genome projects.

13. Ancestry Prediction:


Predicting the Ancestry of an individual based on his/her genetic signatures or SNPs.
mitochondrial SNPs are used in predicting Maternal ancestry because Mitochondria is passed ONLY through mother to the child.
Y chromosome SNPs are used in predicting paternal ancestry becuase Y chromsome is passed from Father to the child.
Ancestry is one of the successful field in Bioinformatics. Genography project by Dr. Spencer Wells is one of the finest one.

14. Mathematical Modelling:


Using mathemetics to predict the out come of some complex real time problems which cannot be done in lab or in reality. Ex: population dynamics.

15. Ethnicity Prediction:


Predicting the ethnicity of an individual by using genetics variations. Each ethnicity is defined by a set of genetic variations.

16. Functional Domains prediction:


Predicting the protein domains which are functionally important from its protein sequence like active sites in a protein.

17. Motif Prediction /Pattern matching:


Predicting the motifs or motif clusters which are functionaly important.
Ex: regulatory motifs, Binding site motifs ...miRNA motics ..repeat motis ...Microsatellites are also a kind of motifs.

18. Protein - protein interaction :


Protein–protein interactions occur when two or more proteins bind together, often to carry out their biological function. Many of the most important molecular processes in the cell such as DNA replication are carried out by large molecular machines that are built from a large number of protein components organized by their protein–protein interactions. Protein interactions have been studied from the perspectives of biochemistry, quantum chemistry, molecular dynamics, chemical biology, signal transduction and other metabolic or genetic/epigenetic networks. Indeed, protein–protein interactions are at the core of the entire interactomics system of any living cell.

19. Protein folding


One of the famous and most important and still unsolved problem.

20. Database development:


In some sense Bioinformatics is called as "Comparative Method". Because Bioinformatics depends on Databases for all of its analysis. So developing data base is a very important project. Many companies surviving by devloping and updating the databases.

NCBI , PDB and UCSC genome browser are some of the very important databases.

21. Software development:


Incorporating the usage of Softwares in Biological analysis is called "Bioinformatics".

22. Developing Bioinformatics Methods/Approaches 


23. Primer designing

 

 One of the most important factors in successful automated DNA sequencing is proper primer design.
 
24. Modeling genetics History
25. Ancient DNA
26. Population Genetics Simulations
27. Finding SNPs
28. Genome wide Association Studies
29. Systems Biology

Systems biology is a biology-based inter-disciplinary field of study that focuses on complex interactions within biological systems, using a more holistic perspective  approach to biological and biomedical research.

30. Homology Search


(1) A degree of similarity, as in position or structure, and that may indicate a common origin; a correspondence of structure
(2) (evolutionary biology) A state of similarity in structure and anatomical position but not necessarily in function between different organisms indicating a common ancestry or evolutionary origin
(3) (genetics) A condition denoting to the pair of chromosomes having corresponding genes for a particular trait or characteristic


31. Computational Genomics


Computational genomics is the study of deciphering biology from genome sequences using computational analysis, including both DNA and RNA.

http://123bioinformatics.blogspot.com/2008/03/branches-of-bioinformatics.html

Monday, December 3, 2012

Definition of Bioinformatics given by NIH

NIH WORKING DEFINITION OF BIOINFORMATICS AND

COMPUTATIONAL BIOLOGY

July 17, 2000

The following working definition of bioinformatics and computational biology were developed by the BISTIC Definition Committee and released on July 17, 2000. The committee was chaired by Dr. Michael Huerta of the National Institute of Mental Health and consisted of the following members:

Bioinformatics Definition Committee

BISTIC Members  : Michael Huerta (Chair) ,Florence Haseltine , Yuan Liu
Expert Members : Gregory Downing, Belinda Seto

Preamble

Bioinformatics and computational biology are rooted in life sciences as well as computer and information sciences and technologies.  Both of these interdisciplinary approaches draw from specific disciplines such as mathematics, physics, computer science and engineering, biology, and behavioral science.  Bioinformatics and computational biology each maintain close interactions with life sciences to realize their full potential. Bioinformatics applies principles of information sciences and technologies to make the vast, diverse, and complex life sciences data more understandable and useful. Computational biology uses mathematical and computational approaches to address theoretical and experimental questions in biology.  Although bioinformatics and computational biology are distinct, there is also significant overlap and activity at their interface.

Definition

The NIH Biomedical Information Science and Technology Initiative Consortium agreed on the following definitions of bioinformatics and computational biology recognizing that no definition could completely eliminate overlap with other activities or preclude variations in interpretation by different individuals and organizations.

Bioinformatics:  

Research, development, or application of computational tools and approaches for expanding the use of biological, medical, behavioral or health data,including those to acquire, store, organize, archive, analyze, or visualize such data.

Computational Biology:  

The development and application of data-analytical and theoretical methods, mathematical modeling and computational simulation techniques to the study of biological, behavioral, and social systems.

 

Sorce: www.bisti.nih.gov/docs/CompuBioDef.pdf

Monday, November 14, 2011

முட்டையில் இருந்து கோழி வந்ததா? அல்லது கோழியில் இருந்து முட்டை வந்ததா?

முட்டையில் இருந்து கோழி வந்ததா? அல்லது கோழியில் இருந்து முட்டை வந்ததா? என்ற கேள்விக்கு நீண்ட நாட்களாக பதில் அளிக்க முடியாமல் இருந்த நிலையில், தற்போது கோழியில் இருந்துதான் முட்டை வந்ததாக விஞ்ஞானிகள் கண்டு பிடித்து உள்ளனர்.

இங்கிலாந்தில் உள்ள ஷெப்பீல்டு, வார்விக் பல்கலைக்கழக விஞ்ஞானிகள் இதுபற்றி ஆய்வு நடத்தினார்கள்

முட்டையின் செல்களை சூப்பர் கம்ப்யூட்டர் மூலம் ஆய்வு செய்ததில் முட்டையின் செல்கள் வோக்லெடின்-17 (ovocleidin-17) என்ற புரோட்டின் மூலம் உருவாகி இருந்தது.இந்த வோக்லெடின்-17 செல் கோழியின் உடலில் இருப்பதாகும்.அதுதான் முட்டையாக மாறி இருக்கிறது.

வோக்லெடின்-17 புரோட்டின், கிறிஸ்டல், நியூகிளீசாக மாறி தானாக வளர்ச்சி பெற்று முட்டை செல்களாக மாறுவது இதன் மூலம் கண்டு பிடிக்கப்பட்டது.

எனவே கோழியில் இருந்துதான் முட்டை வந்துள்ளது என்று அடித்துக்கூறுகின்றனர் அந்த விஞ்ஞானிகள்!
Source:http://askintamil.com/?p=1941

           It's the age-old question that has puzzled the finest minds for thousands of years – which came first: The chicken or the egg?Now, scientists claim to have finally discovered the answer to the conundrum -- it's the chicken which came first.
         A team from University of Sheffield and University of Warwick has found that a protein called ovocleidin (OC-17) is crucial in the formation of eggshells.It is produced in the pregnant hen's ovaries so the correct reply to the egg riddle must be that the chicken came first, the scientists say.
         However, the research does not come up with how the protein-producing chicken existed in the first place, the 'Daily Express' reported.The team used a hi-tech computer, called HECToR, to look at the molecular structure of a shell.They discovered that OC-17 acts as a catalyst, kick- starting the conversion of calcium carbonate in the chicken's body into calcite crystals.



           It is these that make up the hard shell that houses the yolk and its protective fluids while the chick develops.
Lead scientist Dr Colin Freeman of Sheffield University said: "It had long been suspected that the egg came first but now we have the scientific proof that shows that in fact the chicken came first."The protein had been identified before and it was linked to egg formation but by examining it closely we have been able to see how it controls the process. It's very interesting to find that different types of avian species seem to have a variation of the protein that does the same job."
            The scientists now hope the breakthrough could be used in industry to help develop new materials.
Team member Prof John Harding said: "Nature has found innovative solutions that work for all kinds of problems in materials science and technology. We learn a lot from them."
             Calcite crystals are found in numerous bones and shells but chickens form them quicker than any other species, creating six grams (0.2oz) of shell every 24 hours. Once the shell has formed, the chicken expels the egg.
Source:http://www.indianexpress.com/news/its-official-chicken-came-before-the-egg